在丧尸爆发的末日中，巡之丘学园的少女们被困校园。看似天真无邪的由纪，实则因精神创伤活在幻想中，把丧尸当作“邻居”。其他三人——胡桃、悠里、美纪——既要保护她，又要寻找生存资源。她们在图书馆、屋顶搭建安全区，但物资日渐匮乏，外部危险逼近。一次外出补给时，悠里为救同伴被咬，毅然自我隔离。胡桃和美纪试图寻找疫苗，却发现由纪的幻想是她们坚持下去的唯一动力。最终，她们决定离开校园，前往未知的避难所，但前方的路充满绝望与希望。